Simijaca en lengua Chibcha significa naríz o pico de lechuza. La primera fundación fue realizada por Rodrigo Mexia Serrano el 26 de febrero de 1586, pero esta población fue efímera y cuando el Oídor Luis Enriquez realizó visita en julio de 1600 los in dios no estaban poblados ni el encomendero había construido la iglesia. Por auto de 2 de agosto de 1600 proferido en Cucunubá fundó el nuevo y actual pueblo de Simijaca formado por los indios de Simijaca y los de Fúquene y los de Nemoguá.

Por escritura de la misma fecha contrató al albañil Juan Gómez de Grajeda para construir la iglesia. En la visita del Oídor Andrés Verdugo y Oquendo el 10 de mayo de 1756 se relacionaron 852 indios. La primera partida de bautismo data del 11 de marzo d e 1637 firmada por el cura Higinio López de Partearroyo. El 7 de mayo de 1798 el alcalde Custodio Nieto certifica que se derribó la capilla mayor antigua e hizo una nueva.

El 20 de abril de 1816 el General Manuel Seviez acampó en la casa de la hacienda "Cerca de Piedra" llevando la imagen de la virgen de Chiquinquirá. El 1o. de noviembre de 1899 por equivocación se libró un combate entre las fuerzas gobiernistas comanda das por el coronel Carlos Franco. En la plaza principal se levanta un busto de la Pola, inaugurado el 17 de noviembre de 1917.

Se dice que en 1842 se inició la construcción de una nueva iglesia la que fue demolida en agosto de 1957, año en que se comenzó la actual por el párroco Rafael Reyes Barrero sobre planos del arquitecto Luis María Becerra Martínez, fue inaugurada el 13 de diciembre de 1967. La casa cural la terminó el padre Luis E. Forero el 22 de junio de 1969.